其时，熹宗身边权力最大的只有一人--魏忠贤。在孙承宗为军务殚精竭虑的时候，魏忠贤正在暗地里忙着扩张权力。他见孙承宗功劳不小，便有意套套近乎，所以高高兴兴派了狗腿子刘应坤去向孙承宗表表诚意。
但孙承宗生性正直，见到刘应坤这货后，一句话也懒得跟他讲。魏忠贤由此记恨上了孙承宗。后来，魏忠贤迫害朝中大臣，将杨涟等驱逐出京，孙承宗那时正在巡视蓟州，心急回不了京城，便想以贺寿为由入朝面奏，好赶紧告诉熹宗魏忠贤的狼子野心。
魏忠贤忙跑到熹宗床前，涕泪横流地说皇上呀可千万不能让擅自离岗的孙武将回来呀。熹宗听罢，连夜派人快马阻止孙入京。魏又假传圣旨给九门的宦官，说如果孙承宗那个家伙敢进城，就麻利儿把他绑了。结果，孙承宗到达通州后，接到熹宗旨意，垂头丧气地返回辽东去了。魏忠贤又让党羽联合上书诋毁孙承宗，万般糟心之下孙承宗自请辞官回乡，住回了老家高阳县。
