然而，由于洪秀全并没有拥有先进的思想指引和正确的指挥谋略，导致太平天国在之后四分五裂，人们只想为自己争夺到更多的利益，不免算计他人，甚至发起了几次不小的内部战争，这无疑让太平天国的势力日益衰退。
而官军则是抓住时机，一举击退他的军队，为了保命，洪秀全只能带着他的残余军队仓皇而逃。
尽管他依旧存在着东山再起的理想，但是自己的势力已经大不如以前，而现在的自己也已经垂垂老矣，日薄西山，他最终还是在1864年6月1日因病去世。
在洪秀全的势力土崩瓦解后，官府还是将各个省的名字全部改回，洪秀全之前所取的名字一个都没保留。
