明朝在历史书上的时间算到崇祯年间，但其实崇祯以后，明皇室还是在一定程度进行了反抗，南明安宗弘光帝（原福王）、绍宗隆武帝（原唐王）、昭宗永历帝（原桂王）等，本身作为皇帝以下地位最尊贵的亲王，并不同于刘秀刘备那种身份已是平民的宗室。他们建立的政权曾一度获得反清势力的支持，当时南明诸省治下的百官三军与百姓，乃至投效大明的前闯军前献军的将领，无不坚信弘光隆武永历诸帝就是名正言顺的大明天子，天经地义的神州之主。给崇祯帝上"明思宗""明毅宗"这些谥号的，正是南明弘光帝，而从来并不是宣布崇祯为亡国之君的满清。
明朝真正终结时间，通常可以划到1662年，永历帝殉国。
康王赵构在杭州重新整理班子，建立起新的朝廷使得赵氏宋朝又得以延续百年的国祚，一度迎来中华文明史上，文化领域的另一个繁荣盛世，至少使得南方的中原汉文明得到很好的保存。
然而朱由崧为核心的南明却没有完成复国大业，在更迭了几任皇帝后，终于还是被清朝彻底取代。
