到了康熙时期，更是制定了"兴黄教以安众蒙古"的策略，在蒙古地区建立了大量的喇嘛寺庙，不断提高喇嘛的政治地位，鼓励更多的蒙古人出家为喇嘛，并规定如果有人出家为喇嘛，便可以减免徭役，因此很多蒙古人开始出家做喇嘛，从此信仰黄教的蒙古人越来越多，也因此改变了他们那种尚武的性格，朝廷想要控制他们，也变得简单许多。
但是这样的政策也带来了一个新的后果，那就是蒙古人口的锐减，由于大量的蒙古人出家为喇嘛，而喇嘛又不能结婚生子，到了满清中后期，蒙古人口锐减两百万，和成吉思汗统治前的人口相当，这样的政策，表面上是为蒙古人谋福利，但实际上却让他们逐渐趋于温顺，为清朝的统治带来了更大的方便。
