公元1206年，贵由降生在蒙古乞颜部的大帐之中，作为窝阔台乃马真的第一个儿子，自然集万千宠爱于一身。自孩童时起，窝阔台就将贵由带在身边，希望将他培养成一位出众的蒙古勇士。
然而和其他蒙古人不同，少时的贵由不爱骑射，不喜征战，反而对中原汉制抱有浓厚的兴趣，他多次出入时任蒙古丞相耶律楚材的营帐之中，向其请教中原诗书之事，这使得窝阔台对其极为不满。
不久之后，年轻的贵由感染了一场重疾，痊愈之后他发现自己的关节远不如以前灵活，强壮的身躯也日益瘦弱，与窝阔台心中强大的蒙古勇士形象大相径庭。而且重疾使得贵由性情大变，从知书达理的少年变成了意气用事，飞扬跋扈的纨绔子弟。
以上种种外在或内在的原因，使得窝阔台对这个儿子愈加厌恶，这也标志着窝阔台是不会将汗位传给长子，从而埋下了动乱的种子。
