军队纪律，也是战斗力的一部分。湘军纪律较为严明，特别是王錱率领的老湘营。1853年7月，老湘营一支先头小部队赶到桂阳县田墟庄驻扎。当地一个姓黄的士绅带着自家的大米、猪肉前来犒军。可是，士卒没有得到王錱的命令，不肯进食，挨了一天一夜的饿。
第二天，当王錱赶到田墟庄，了解情况后，才下令让士卒进食。
在严明的纪律约束下，湘军极少出现不战而逃的现象。
在军队纪律上，淮军就差远了。虽然淮军武器装备比较精良，但他们没有配以严明的纪律，战斗意志不及湘军。为了维持淮军的战斗力，李鸿章对他的部将和属官的贪财行为，总是睁一只眼闭一只眼。
淮军在战场形势顺风顺水时还好说，一旦出现劣势，就容易出现"兵败如山倒"的情形。
在1894年爆发的中日甲午战争里，淮军大将叶志超在平壤之战中临阵脱逃，狂奔500里，将朝鲜全境拱手让给日军；另外几名淮军大将龚照玙、黄仕林、赵怀业、卫汝成等在金旅之战中不战而逃，将渤海湾送给日军，让北洋水师基地威海港暴露在日军的炮口之下，对北洋水师的全军覆没负有不可推卸的责任。
