指导思想不纯，就造成了两个后果：一是破坏性强。因于基督教是一神教，只有一个神，那其他的神、仙都不能信了，因些太平军到哪一个地方都要把土地神、寺庙这些民间信仰破坏掉，孔子也被丑化成一个小丑。这样的破坏性容易引起人们的恐慌，所以很多地方的人都把太平军称为"长毛"，把他们当强盗土匪对待。另外因为他们丑化孔子，也引起儒生的不满。本来像容闳、钱江、王韬这些读书人都曾到太平军中，但是看到他们搞得实在不像样，就都纷纷走掉了。二是得不到外国人的支持。本来有些外国人听说他们拜上帝，都想支持他们，但是深入了解之后，发现他们拜的上帝跟自己信的上帝不是同一个上帝，于是也纷纷走掉了。
有的同学可能会说，太平天国不是有一个《资政新编》吗？这个纲领不能说不先进吧。的确，《资政新编》是一个具有西化色彩的政治纲领，是太平天国的一个亮点。但是，这个纲领根本没有真正实施过，他们实施的始终是《天朝田亩制度》。《资政新编》只是洪仁玕提出的一个空想。洪仁玕本人对于挽救太平天国的危亡也没有起到太大的作用。
（洪仁玕）
