归降清朝的洪承畴虽然依然被授予太子太保、兵部尚书兼都察院右都御史，入内院佐理军务，但他并未忘记身为儒家学子"治国平天下"理想。
清军入关后，在洪承畴的"剿贼"计策下，多尔衮在山海关击败李自成的部队。随后就将进取中原，为了使中原百姓免遭涂炭之苦，在洪承畴的建议下清军宣称只为灭"贼"，绝不扰民，明朝官吏开城投降者升职优待，抵抗者杀。清军兵不血刃的收取了许多城池，使百姓免于池鱼之灾。
安定江南
清军占领江南后，在洪承畴的建议下，大量起用明朝的降臣，这对当时政局的稳定，经济文化的发展都具有重要的意义。并且还减免了江南的赋税，例如，请求清政府减免钱粮，免除漕运税等。尽量避免过多的武装冲突和流血事件的发生，缓和了民族矛盾。
