明军攻占元大都后，并没有将这里作为都城，朱元璋将这里改名为北平，后来派儿子朱棣来这里驻守。朱棣发动靖难之役，从侄儿朱允炆手中夺得皇位后，决定迁都到自己的老巢，于是下令在北平修建都城，并将这里改名为北京。之后，北京就一直是明清两朝的首都。
明朝末代皇帝崇祯帝朱由检，继承的是哥哥朱由校的皇位。他接手的明朝，已经内忧外患严重。内部东林党、阉党等相互倾轧，外有后金挑衅，还有农民军起义造反。崇祯即位后，先是清算了阉党，然后重用袁崇焕等人对抗后金，可惜后来他中了皇太极的反间计，将袁崇焕处死了。
崇祯和元顺帝一样，其实有心挽救国家，只是有心无力。在后金和农民军的双重打击下，崇祯不禁发出"苦我民尔"的感叹，可是他根本没办法改变。眼看明朝大势已去，在无力回天的情况下，崇祯决定"君王死社稷"。
他将儿子们托付给岳父，然后下令后宫妃子殉国。为了不让女儿受辱，崇祯一狠心，竟亲手刺死了6岁的女儿昭仁公主。而在面对另一个女儿长平公主时，崇祯狠不下心，因此长平公主只是受伤昏死过去。
