此后云游四方，没人知道他究竟去了哪里。到正统年间（1436-1449年），有人在云南发现一处石壁上有"流落江湖数十秋"的题词，当时有御史觉得不对劲，于是做了调查，找到一老和尚，自称建文帝，后来带到北京验证身份，大家认为是建文帝，当时这位老和尚已经七八十岁了，后来就没有下文了。万历皇帝越听越好奇，于是叫张居正把全诗读给自己听。
他深思一会后，语重心长的对小皇帝说："本朝史官从未记录过建文帝的下落，臣等听说民间有传言，说建文帝出宫之后在山林云游，得其所哉，逍遥自在。皇上不要担心，此事日后不必多提。"他的回答不得不让人佩服，既避免了自身遭难，也正确引导了小皇帝的思想发展，往事不用再提，应该注重的是当下。
