2002年济南大旱，千年没枯的五龙潭竟干枯了，水域面积减少到很小的一块。由于潭中放生着许多的鱼和龟，为了不让他们受灾，园林工作人员打算给他们换个有水的地方。但神奇的是，潭中水虽已很少，却不见鱼和龟的踪影，而且五龙潭与外界水系是隔绝的，鱼和龟不可能游到外面去。更为神奇的是，后来雨水增多，五龙潭又开始涌泉，这些鱼和龟又出现了。为此有人断言，潭下必有神秘通道，也验证了秦琼府邸的传说。
最近一次发生在2004年10月29日的后半夜，千年名泉五龙潭的中间位置忽然塌陷了，裂出一条长6米、宽半米的大口子。据当时在场人员说，裂口处深不见底，周围聚集了大量的鱼，看着非常的恐怖。由于无人知道此潭水深多少，所以当时也没贸然派人下去查看。不过济南的老市民不约而同的说起了一个让人恐惧的传闻“天尤怒，潭自危”。