袁崇焕又胜了，不过等着他的并不是重赏而是阉党发起的弹劾，责问他为何不救锦州。于是，袁崇焕怒了，辞官回乡，辽东由王之臣接管。直到崇祯帝即位后，袁崇焕才被召回。
问题是，两年时间内，大小凌河的关隘重新修整了吗？这为两年后的己巳之变埋下祸根。
首先，构陷孙承宗，派阉党高第接管辽东，放弃关锦防线，坐看袁崇焕一人与努尔哈赤苦战。宁远大捷后，高第被下课，又安插阉党刘应坤、纪用到辽东。
其次，宁锦大捷后，弹劾袁崇焕不发兵救援锦州，袁崇焕被迫辞官回乡，错过了重新修复大小凌河关隘的时机，为两年后的"己巳之变"埋下祸根。
