要说一个皇帝最忌讳的事情，莫非就是手下的功劳比自己还高，这会威胁到皇权的尊严。在张居正独揽朝政的时候，不仅仅是作为臣子，当时的张居正还是万历的老师，对于年少的万历管教非常的苛刻，即便是新政推广初期，万历的安排全部都是听从张居正的。随着时间的流逝，万历皇帝也逐渐成熟，有了自己的看法，他对张居正的印象也是极差，在万历皇帝眼里，张居正就是一个谋朝篡位的奸佞之徒。整个朝廷基本握在张居正的手中，所有人都知道国家的实权掌握在谁的手中，每人敢得罪他。在当时，有一副对联引起了很大的轰动，有一名叫做邱岳的官员，写了一副对联。上联主要是对于当朝天子的歌颂，"日月并明，万国仰大明天子"，下联是专门夸赞当朝宰相张居正的，"丘山为岳，四方颂太岳相公。在中国的对联文化中，下联要比上联重的多，在这幅对联中，很明显的就可以看到，下联主要讲的是当朝的宰相张居正，一眼就可以看出张居正的地位比皇帝的地位还要高。也就是这样的地位还有这样的事情，才让万历皇帝十分痛恨张居正。
三、张居正有贪污之嫌，没收他的财富上缴国库
在明朝，几乎大部分的官员都是有过贪污的，既然贪污厉害，那皇帝抄家也厉害，皇帝很喜欢抄家，既能够惩办贪官，也能够增加国库收入，多好的一件事。张居正位居高官，家境自然非常殷实。在明史中有过记载，当时官兵在张居正死后，在他家搜出了万两黄金，十万两的白银，拿着这些钱去逼迫张居正的长子，承认张居正的一切罪行。而最惨的，便是张居正的家人，张居正加的几十口人有很多饿死，他的儿子被刑法折磨致死，妻子也惨遭毁容。
