在姚广孝的劝说下,朱棣最终决定起兵造反。姚广孝给朱棣出了个注意,挖空了王府的后院,悄悄的在密室中打造兵器。朱棣把这件事全权交给了姚广孝,姚广孝很聪明,还知道饲养一些鸭子来掩盖打造兵器发出的声音。燕王府中当时也有朱允炆派去的眼线,但是这些人从来没有怀疑过姚广孝。
他是个僧人,大家都以为他不会掺和到这些俗事中去。正是得益于姚广孝的相助,朱棣最终在朱允炆的眼皮底下招兵买马,顺利起兵。在征战的过程中,姚广孝还给朱棣出了很多好主意。朱棣本是想要逐个击破,最终再包围京师。但是姚广孝不赞同朱棣的想法,他建议朱棣应该一鼓作气,直取京都,打朱允炆等人一个措手不及。
若是打包围战,就等于是给了朝廷一个喘息的机会,其实对于己方是不利的。朱棣最终听取了姚广孝的意见,一举攻下了京师。登基上位之后,朱棣册封姚广孝为太子少师,让他教导太子。姚广孝出家是为了不造杀孽,但是朱棣的靖难之役却害死了将近50万百姓。对于这50万人的死,姚广孝是必定要负责的。