第四个原因就是，他跟着李世民的时候，李世民已经有了自己的势力范围。秦叔宝一生追随的主子很多，刚开始的时候他跟着隋将来护儿混，随后又跟着隋朝名将张须陀，还帮着他去攻打李密。结果不幸的是，张须陀死在了李密的计谋之下，所以秦琼只好投靠了裴仁基，最后又辗转到了李密的麾下。当然，对于秦琼来说，李密算是一个不错的主子，至少他是受到重用的，还让他当了帐内骠骑。李密死后，他又投靠了王世充，最后在唐高祖武德年间，投靠了大唐。成为了李世民手下的一名悍将，但因为他前半生的经历，所以不免受到统治者的猜忌。
第五个原因就是，秦琼跟李渊关系比较高。秦琼跟李渊可谓感情深厚，这一点从李渊对他近乎肉麻的信中，就可以看出来。在秦琼三败尉迟恭、打垮宋金刚之后，李渊专门送给他一个金瓶子让他装酒用，这是包括李世民在内都没有的待遇。秦琼做先锋打败王世充后，秦琼就被封为翼国公（第一等公爵，与郡王同为从一品），又赏赐黄金百斤、帛七千段。 打败窦建德的继承者刘黑闼后，又得到了数不清的赏赐。
这里要说两句话：第一，这都是李渊封的，而当时尉迟恭和程咬金连个侯爵伯爵子爵都不是；第二，上柱国等于特级战斗英雄，尉迟恭和程咬金到死也没混上这个称号。可以说，秦琼在李渊执政的时候就已经荣耀至极，无可再封了。其实历史是公正的，唐高宋时期，高宗看不惯兄弟相杀的玄武门党争，单独祭奠了没有参与玄武门之变秦琼，等几位凌烟阁功臣，把参与了玄武门之变，尉迟恭和程咬金等十几位功臣晾在一边。老百姓也看不惯兄弟相杀的玄武门之变，所以在民间传说中，没有参与党争的秦琼，地位一直远远高于尉迟恭和程咬金。
