在这种情况下，洪秀全虽然还是掌门人，杨秀清的地位似乎要高过他，毕竟两人的"辈分"在那里。1951年，洪秀全在永安城分封诸王，太平天国的主将们都被封王，但是他们都需要受到东王杨秀清的节制。
1953年，太平军进入金陵城，在百姓和将士们的拥护下，洪秀全在这里修缮了两江总督衙门，并且正式宣布定都金陵，将其改名为天京，但是这时候洪秀全只是一个名义上的君王了，权力实际上都已经落到了杨秀清的身上，而且两人虽然面和但心不合，对一件事总会产生两种不同的意见，导致下属们也头痛得很。
据记载，定都天京后，洪秀全曾经想将四书五经列为禁书，但是杨秀清不愿意，后者利用"天父下凡"来迫使洪秀全听取他的意见，洪秀全无法，只好同意将修改后的四书五经刊印流转。
那么，在这种情况下，杨秀清大权在握，不应该怕一个身为傀儡的洪秀全，为何他又在天京事变中毫无抵抗之力，就此殒身呢？英国曾经公开了20道圣旨，便将其中的原因之一展露给了世人。
