为收拾广东民心，朱由榔于十一月十二日东返肇庆，十八日宣布即皇帝位，改第二年为永历元年。同时，追尊其父朱常瀛为端皇帝，兄为桂恭王；嫡母王氏为慈圣皇太后，生母马氏为昭圣皇太后。至此永历朝廷正式建立。一个月后，由于清军来势汹汹，永历帝君臣再次放弃肇庆，逃往梧州。从此永历朝廷居无定所，终其灭亡，始终处于一种颠沛流离的状态。
通过吴三桂与满洲将军的对话我们得知，满洲虽以异族入主中原，但不失对永历帝之尊敬；吴三桂以汉人之身份刀劈旧主，不愧为铁杆汉奸。讽刺的是，吴三桂发兵三藩之乱时，打出的旗号是"反清复明"，康熙帝为了羞辱及向全国百姓昭告吴三桂的狼子野心，把吴三桂奏请斩除永历帝的奏折宣告天下。搞得吴三桂狼狈不堪，难以应付。
