在这场战争中，清军俘获大批的太平军俘虏，这些俘虏的下场非常悲惨。据记载，太平军只要落到了清军手中，那么就会被清军当众绑在柱子上凌迟处死，而且不管男女老少，都在百姓面前行刑，杀鸡儆猴，让百姓们不敢再参加太平军。
而另一边的太平军对待这些俘虏，要宽容得多。因为太平军大部分都是平民，所以他们几乎都是汉族人民。他们俘虏了清军之后，先要问清他们是不是满人，如果是满族人，那么他们将会立马处死他们，没有任何凌虐。如果他们是汉族人，那么太平军就会网开一面，问他们是否愿意加入他们，如果愿意，那么就冰释前嫌；如果不愿意，愿意以身誓死，那么太平军也会给他们了解。
从清军和太平军对待俘虏的态度可以看出，百姓们更加畏惧清军，但却更加喜爱太平军。
