后来江充派人在太子宫中挖出一个桐木人，刘据得知后惊恐不已，他知道已经无法证明清白，于是就捉住江充，亲自将他斩首，并骂道："赵国的奴才，陷害赵王父子还不够吗？现在又来害我们父子！"
此外，刘据还一并将那些胡人巫师也在上林苑中活活烧死，刘据自知惹下大祸，便下令发动兵马自卫。此时汉武帝在甘泉宫听闻消息，立即命丞相刘屈嫠调兵负责平乱。于是朝廷兵马与太子在长安城中混战五日，死者数万人，血流成河。后来太子兵败逃亡，被汉军围捕在长安东边的湖县泉鸠里，刘据悬梁自尽。太子的夫人以及两个儿子一门全都被杀戮，只留下一个尚在襁褓的皇孙。
这场大乱，史书称之为"巫蛊之祸"，不仅白白导致了好几万人死亡，就连汉武帝自己也弄得骨肉相残。此事过后巫蛊这种东西人们再也不相信了，连武帝自己也逐渐觉悟，他知道是江充从中作祟，于是命人诛杀了江充的三族，后来他又修建了"思子宫"，在太子刘据被害的地方修建望思台，以此表示自己的哀思。
因为江充这个医生，汉武帝最终逼死了自己的亲生子，这件事不仅让武帝一世英名大打折扣，也让他带上了昏君的标签。
