方孝孺在建文帝朱允炆登基后，被召到皇帝身边，职位叫做侍讲学士，具体的工作嘛，其实就是皇帝的顾问，皇帝有事情可以征求他的意见。朱允炆的政治能力是不足的，有时候竟然要方孝孺在屏风后面听大臣奏事，帮他拿主意。建文帝实际只当政了4年时间。在建文帝一朝最重大的事情莫过于削藩，随后引发了靖难之役。在靖难之役过程中，方孝孺给建文帝出的计谋，实际上可说是"流于迂腐，无一可用"。
虽然朱棣发起靖难，夺得皇位，但他是篡位，名不正言不顺。朱棣也深知这一点，所以他想得到舆论的认可，让自己的即位具备合法性。如何做到这一点？让名人大儒书写即为诏书就是比较好的办法，以大儒的号召性让天下文人认可自己这个篡位者，文人控制住了，舆论也就倒戈了，朱棣的继承之路便畅通无阻。很明显，方孝孺就是这个最佳人选。方孝孺是天下大儒，被姚广孝成为读书种子，他在文人中的号召力与影响力极大，如果朱棣得到方孝孺的认可，基本上也就得到了读书人的承认，让方孝孺归服，朱棣势在必得。
朱棣虽然在靖难之役中取得了胜利，又是建文帝的叔叔，他此时虽然取得了地位、权利，但毕竟是通过战争而来，在古代是讲究名正言顺的。所以朱棣就想通过方孝孺的影响，来达到名正言顺的效果。朱棣就想让方孝孺起草即位诏书，但是方孝孺不仅拒绝为朱棣起草诏书，而且还出口大骂。因此触怒了朱棣。于是朱棣就下令将方孝儒孺杀了，其家族之人亦不少牵连至死的。
