等待两军正面交战后不久，明军许多将领已萌去意。大同总兵王朴首先率领部下逃跑，马科、吴三桂也随即率领部下人马逃走。
明军军心大乱，清军趁机从后面追杀，明军伤亡惨重，数十万大军转瞬间被清军斩杀5万3千多人，自相践踏死伤无数。
洪承畴率领一部残兵被清军围困在松山城，1642年3月，在松山城副将夏承德的暗中接应下，清军攻破松山城，洪承畴、巡抚邱民仰被俘，总兵曹变蛟等人被杀。
紧接着，锦州总兵祖大寿率众献城投降清军，塔山、杏山也落入清军手中，昔日明军的锦宁防线，不复存在。
那么纵观明清松山之战，明军在战略战术上，背离老祖宗留下的谋略思想太多，因此是必败无疑。
