其实在北京城陷落的前两个月，数位大臣苦口婆心的劝谏崇祯帝迁都南京。他们的理由非常充分：关外吴三挂的20万大军粮草不继，又被后金拖住，无法回救京师。陕西的左良玉屡战屡败，自身难保，北京城周围已经没有可以调用的兵力。京师成为一座孤城，孤城不可守，这是稍微有点军事常识的人都知道的事情。而恰恰相反的是，江南数省是朝廷赋税重地，尚有50余万军队驻扎，如果迁都南京，仍然有势力和大顺军决一死战，大明朝国祚还能延续下去，出乎大臣们预料的是，崇祯皇帝根本就不考虑迁都的问题，还一个劲的逼迫大臣向朝廷捐献军饷。
崇祯皇帝的独断专行带来了致命的恶果，不断有大臣向大顺军投降，到北京城破的当天，连崇祯皇帝托孤的成国公朱纯臣都开了城门投降大顺军，绝望之下的崇祯皇帝自杀殉国，算是为大明朝的列祖列宗保留了一丝颜面，崇祯是个很有才华的皇帝，在登基为帝的17年时间里，勤勉朝政，以身作则，为挽救大明朝可谓尽力尽力。当他自杀身亡以后，不管是造反的大顺政权，还是入寇的大清朝廷，都没有问崇祯皇帝的罪。他们对崇祯的遭遇非常同情，对他进行了厚葬，这在中国历史上的改朝换代中是比较罕见的。
当时的大臣们对崇祯皇帝拒绝迁都一事耿耿于怀，满清王朝的统治者也对此疑惑不已。然而当清军攻入北京城后，搜出一份圣旨，清朝的统治者阅读了圣旨了内容，才知道崇祯皇帝宁死不愿意迁都的正真原因。这是一份明成祖朱棣下给后世皇帝的密旨，密旨上写到：临外敌入侵，大明不和亲，不称臣，不纳贡；天子守国门，君王死社稷。怪不得崇祯皇帝对迁都一事不予考虑，最后选择自杀，原来这是祖先立下的规矩，崇祯皇帝只是在贯彻执行祖先的命令而已，还是很让人感动的。
崇祯皇帝死后明朝宗室在南方苦苦支撑了20多年，先后立了四位皇帝。弘光帝朱由崧被杀，隆武帝朱聿键绝食身亡，绍武帝朱聿鐭自缢而死，朱家子孙果然没有丢列祖列宗的脸，没有一位皇帝向满清投降。公元1664年，永历帝朱由榔被吴三桂所杀，明朝皇室彻底走下了历史舞台。
