等到方孝孺如梦初醒，要求建文帝诛杀李景隆时，一切为时已晚。最后朱棣在率军渡过长江，南京城危在旦夕时，方孝孺又给朱允炆提供了一个错误的建议。他建议朱允炆固守京城以待援兵，如果最终失败，应当君王死社稷。
眼看南京城不保，有人劝说建文帝暂避锋芒，毕竟大半个国家，仍在建文帝的控制中。可方孝孺却力主守城，等待援兵。这样的结果是，陈碹以战舰降燕王，李景隆打开了城门，建文帝本人也消失在了一场大火之中。
朱元璋把儿孙分封到各地做藩王，藩王的势力日渐强盛。因太子朱标早死，皇太孙朱允炆继位，其年号为建文。建文帝与亲信大臣黄子澄，齐泰布置了一系列的削藩措施。他们决定先削那些实力弱小的藩王。在削除弱小的诸王以后，朱允炆认为一切已经准备停当，他便秘密下令擒拿朱棣，但是朱允炆并没有成功。
