慈禧不愿日本威胁到自己的政权，也极其害怕日本再次攻过来，因此连忙派李鸿章等人去日本马关和日本首相伊藤博文、外务大臣陆奥宗光谈判，日本处于优势，更何况日本还没有离开战场，因此狮子大开口，提出赔偿日本军费3亿两等条件。
李鸿章哪里愿意答应，但又害怕日本不停战，并且日本人一直在威胁李鸿章，还有美国顾问科士达怂恿李鸿章赶紧接受条件，日方不断向李鸿章，李鸿章也差点就签字答应了，不过却发生了一件让日本意料之外的事情。
1895年3月24日，第三次谈判结束，李鸿章筋疲力尽向接引寺住所走去，却突然遭到了枪击，使得左眼下受伤，李鸿章遇刺一事迅速传到了清朝和西方国家，引起了一阵轰动，日本受到了各个西方国家的谴责，原本高高在上的日本变得十分狼狈。
日本十分担心其他国家闯进去干涉，恐怕自己所得到的要小上一大圈，因此希望谈判尽早结束，李鸿章也没有急着回去清朝，而是继续谈判，日本和李鸿章签订休战条约，赔款也从原先的3亿两变为了2亿两，让清朝减少赔1亿两白银。
