在古代可能听说过旱灾，涝灾，但是应该很少听到有鼠疫的现象。但是百年难遇的现象就让李自成碰到了。鼠疫其实是鼠疫耶尔森菌借鼠蚤传播为主的烈性传染病，主要流行于野生啮齿类动物间的一种自然的疫源性疾病。主要表现为高热、淋巴结肿瘤、肺部特殊炎症以及出血倾向等症状。感染者的死亡率高达40%-60%，在古代那种低级的医疗科技下，几乎被感染都会面临死亡。
根据史书记载，李自成在进京之前就已经出现大量的死老鼠，很快，军中就有大量的士兵发高烧，四肢无力而且脖子都有肿大的现象，最严重的是一旦患上几乎活不了，这就是鼠疫。其实在朱由检在位期间，鼠疫就已经爆发，只不过到了1644年春天的时候鼠疫大规模爆发，而朱由检轻松被李自成攻破也是鼠疫惹的祸。
当李自成进京之后很快大顺军也感染上了鼠疫，这使得大顺军士兵战斗力减弱，面对强悍的满清当然是力不从心。吃过败仗之后的李自成认为是军力多少的原因，便开始大量地招兵买马，结果刚入军中的新兵很快也被感染得了鼠疫。因为军中都是集体生活，吃喝拉撒睡全在一起，即便是这样有再多的兵力也是无用。外有满清和吴三桂，内有鼠疫，这让李自成万分崩溃，最终痛失江山。
如果当初没有鼠疫的影响，明朝灭亡的速度不会如此之快，李自成的皇帝之位还可以坐得久点，但是命运就是如此喜欢捉弄人！
