唯一的合理答案就是，刘三吾跟朱元璋说的，元朝以来，北方长期处于高压统治，文化遭受极大摧残，本来就民生凋敝，连生活都要不行了，哪还有读书的时间和环境。北方远不如南方，这已是众所周知的事实，南优北劣实属正常。
事实上，刘三吾说的并没有错，从洪武三年第一次科举考试开始，南方举子的成绩，就一直在北方举子之上。南北榜案之前的六次廷试，状元清一色都是南方人。而从录取比例上看，也是南方中榜者越来越多，北方中榜者日益减少的趋势。
南北榜事件的发生，只是给了北方官员发动清算的借口，整个事件中，弹劾考官的御史们，大多来自于北方。后来修《国榷》的谈迁也感慨说：
