首先明朝的灭亡是张居正死后五六十年的事情。所以，明朝灭亡就怪不他的头上。而他的改革主要是一条鞭法和考成法。一条鞭法就是税收货币化，受到了江南地区商人和手工业者的欢迎。至于官员在政策执行上巧立名目加收赋税，那是明朝政府执行力的问题，跟张居正无关。考成法是考核官吏的工作的法，也是好法。
万历帝朱翊钧是明朝21个皇帝中在位时间最长的，在位48年，初期因张居正辅政，国政为之一新，史称"万历中兴"。张居正死后，万历帝为泄愤削其官秩，抄没其家，拘禁、拷虐其子孙，并掘坟开棺戮尸。之后，他沉溺酒色中，为满足其穷奢极欲的生活方式，大肆搜刮天下，为立储之事赌气二十年不见廷臣，遂使朝政崩坏，边防不备，民变此起彼伏，率扑不灭。
