东北鼠疫不仅造成了当地居民的大量死亡，而且还带来了生存压力及经济生活的全面恐慌，特别由于交通断绝而影响了城镇人民的正常生活。鼠疫出现后，清政府下令各处严防。
1911年1月，清政府召集北京所有医生在协和医学堂召开抗击鼠疫大会，商讨相关事宜，并指定协和医学堂为鼠疫防治中心。
运尸队在搬运鼠疫死亡者的尸体（1911年）
为了控制和消灭这次鼠疫，东北三省治疫事务民政司详订章程，分饬各省内外所属州县迅速成立防疫会，负责本地区防疫救治等事务。各省官府成立了以医官为首的卫生警察，负责监督清扫城市卫生和捕鼠；他们身穿特制的防疫服，深入到街巷，挨户访问，把病人搬进临时设立的隔离室，对染疫者或有嫌疑的人采取了有效的隔离、消毒等防疫措施，对病人住处采取严格的隔离消毒措施。
