其一，李秀成的自供状中，没有对湘军作战失误的剖析。事实上，曾国藩的湘军在和太平天国打仗的时候，是存在不少失误的，因而打了不少败仗。李秀成的自供状，是对整个太平天国起义过程的一种回顾。要回顾，就必然要涉及与湘军打仗的问题。但是，李秀成自供状里，这方面却很好。这显然是不可能的。
其二，李秀成总结太平天国失败的原因目的存疑。李秀成在自供状的结尾，对太平天国失败的原因进行了总结，总共得出了"天朝十误"。李秀成总结这个东西有什么意义呢？是为后人造反的时候，提供经验总结吗？这显然是十分荒唐的。如果要让这件事不荒唐，又有逻辑性，他前面的叙述中，必然就有相关内容。而实际上这样的内容没有，很显然，就是被曾国藩给删改了。
其三，李秀成是否投降成为一个谜。在自供状的很多地方，李秀成写太平天国是"匪"，比如"天朝之根已去，能收复此等之人众齐来，免大清心腹之患再生，中堂及中承（丞）大人名成利就，早日完功收复，众匪发何防"等。李秀成既然要投降，他总结太平天国的得失干什么？这也是不符合逻辑的。
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