可惜就这样的崇陵，竟然被盗墓贼惦记上了。1938年，一只不明番号的军队抹黑开进了崇陵，这些人对崇陵的结构很熟悉，盗掘起来亦很内行，他们用用松杆木片拨开各道石门的自来石，很快进入地宫。他们把光绪帝的尸体拖到棺外，再盗走棺内的随葬品。隆裕太后的梓宫也被打开，里面的随葬物也没幸免……
根据在清官档案中存有光绪帝随葬品的清单，主要的随葬品当时都被盗了，其中有绿玉佛手簪、绿玉葫芦、大东珠、饭块珠、珍珠、小飞珠、各色宝石、各种名贵皮毛、绸缎料衣服袍褂等等。
据说，这伙人把盗来的金银珠玉器皿文物卖给了京西八国教会，换得了五百套棉军装！
1980年6月15日，经国家文物局批准，考古队对光绪崇陵地宫进行保护性发掘。清理完墓道和四道石门及各券之后，考古工作者们正式进入崇陵地宫。虽然已经知道崇陵曾被盗掘，心里有所准备，但还是被眼前发看到的情景震惊了：只见墓室内光绪皇帝的棺椁被盗墓贼用锤斧凿开了一个大洞，光绪遗体的脚被盗墓者拉出，光着脚，身上的龙袍破烂得不成样子，而孝定景皇后的遗体与衣物已全部腐烂。陵墓内一片狼藉，随葬宝物被洗劫一空。（后来在棺椁下面暗藏的金井中找到一些残余文物）。
