到了建文年间，因为朱椿在封国口碑很好，没有像其他兄弟那样心怀二志，在封国招兵买马，而是通过劝农减税减轻蜀地人民的压力，因此深得地方百姓的爱戴，又因为朱椿的护卫很少，构不成什么威胁，因此在建文帝的削藩国策中，蜀王朱椿幸运的躲过了打击，而且还得到了建文帝的宠信。
"靖难之役"燕王朱棣入主南京后，朱椿顺应事势表示拥护。永乐十四年（1416年），朱椿揭发同母弟谷王朱橞谋反，成祖朱棣大赞曰："王此举，周公安王室之心也。"下旨赠其赠金银彩缎数万。朱椿病逝于永乐二十一年（1423年），享年五十三岁。
纵观朱椿这一生，除了他有谦谦君子之风外，朱椿好学儒雅的性格及他安民守土的作为，都得到了太祖、建文帝和成祖三代皇帝的宠信和肯定，蜀藩因为朱椿的三代得宠，而一直传到了明朝末年。
