六年后清军又在漠北蒙古的昭莫多重创噶尔丹，经过此番惨败，噶尔丹一蹶不振，在清军的追击下自杀身亡。
不过噶尔丹的死并没有解除清廷的西北边患，他的侄子策妄阿拉布坦继任准噶尔大汗，仍然试图与清廷争夺天下。
在整个康熙年间，清帝国和准噶尔帝国围绕着西藏展开了角逐，虽然清军最终占领了西藏，但准噶尔汗国依然是占据着整个西域。
1727年策妄阿拉布坦暴毙，其子噶尔丹策零继位。眼瞅着准噶尔新主上台，刚继位不久的雍正皇帝坐不住了，他想趁准噶尔汗位交接的动荡之机一举消灭这个宿敌。
1729年雍正帝决定分兵南北两路攻打准噶尔，北路军以傅尔丹为靖边大将军，从外蒙古越阿尔泰山攻击准噶尔腹地。南路军则以岳钟琪为宁远大将军，从甘肃出巴里坤牵制准噶尔军。
