然而瓦剌错误地估计了明朝子民的力量，认为如今的明军也不过如此。因此瓦剌太师也先继续率兵进犯北京，并于此地开展了历史上赫赫有名的"北京保卫战"。
在此次战役中，明朝上下展现出了惊人的团结力。首先，孙太后顾不得儿子安慰，果断改立郕王朱祁钰为帝，以此稳定民心。随后，兵部侍郎于谦又发动人民群众，将通州储存的几百万石粮食在短短几天之内运送至北京，以此稳定军心。
经过明朝上下一致的努力，明军不仅击退了瓦剌军的袭击，成功地保卫了北京城，还多次大败瓦剌，使得瓦剌将在土木堡之变中获得的胜利果实全部吐了回来。
而经此一役，瓦剌也无力挑衅大明王朝，只得求和。
内部矛盾激化，瓦剌持续衰弱
