第一件就是：朱允炆作为新皇帝登基后，按照惯例地方藩王是要进京晋见的，当朱棣到达南京后，户部侍郎卓敬劝朱允炆立刻把朱棣抓起来，削去藩位。但是朱允炆却说朱棣是他的叔叔，不能这样做。或许卓敬不是朱允炆的亲信，他人微言轻，不能让朱允炆采取这宝贵的意见，但是黄子澄却是朱允炆的亲信智囊，他的话朱允炆是无论如何都要听得。
但此人仗着读《孝经》长大，绝不肯用这种卑鄙的手段打败敌人，所以就在朱棣晋见的整个过程中，黄子澄当了一回观众，从头到尾没有发一言、出一个计谋。这就很可笑了，之前在东角门时，黄子澄指点江山说的头头是道，真到了关键时刻却掉链子了，看来黄子澄不仅是书呆子，还是纸上谈兵的一把好手。
黄子澄和朱允炆商议削藩事宜
第二件是：朱棣回到北平不久后，朱元璋的忌日到了，同样按照规定朱棣是要进京祭拜的，但这次他没去，而是派了三个儿子做代表。朱棣的三个儿子进京后，三大顾命之臣中的齐泰就劝朱允炆立刻把这三人抓起来当人质，但是这时黄子澄站了出来，他认为此时行动可能会打草惊蛇。这就很自欺欺人了，前面已经有好几个藩王被削去王位，这时黄子澄却说不能打草惊蛇，简直是愚蠢到了极点。关键是朱允炆偏偏极为信任黄子澄，听取了他的意见，最后放走了朱棣的儿子。
