而清朝，虽然清朝末期的朝廷已经腐朽不堪，但是瘦死的骆驼比马大，清朝毕竟已经稳定发展了很多年，有了一定的根基。并且清朝非常重视汉化，民族矛盾相对元朝来讲较弱。另外别的不讲，光从政治实力上，清朝就已经碾压太平天国。在辛亥革命之前，西方的思想还没有传入中国，中国仍旧是一个彻头彻尾的封建社会，地主乡绅等等这些阶级是满清权贵的主要支持者。虽然太平天国笼络了底层百姓的心，却拉拢不了这些阶级。而没有这些阶级的支持，太平天国就无法壮大自己的实力，提高自己的威望。
还有一点比较重要的就是，朱元璋为北伐提前做好了准备，先是把南方的各大势力都扫除之后，待时局较为稳定时才挥军北上；而太平天国的北伐，匆忙、没有规划。
朱元璋面对的元朝，在经历了内斗、对外扩张的层层消耗之后，实际有战斗力的军事力量已经是所剩无几；再加上朱元璋不仅手下有很多善于领兵作战的良将，并且他手下的士兵跟着朱元璋征战多年，已经具备了一定的军事素养。并且元朝末期的时候，各地都有农民军起义，北方同样也是如此，这对于元朝的力量来讲也是一种消耗。但是太平天国面对的清朝单从实力上来讲，就是元朝远远不能比的。
打仗主要看什么？主要是看国家的军事实力和经济实力。那么首先来分析一下军事实力，虽然太平军看起来数量相当庞大，不过这是太平军所有的军事力量集中在一起的缘故。而清政府一直以来都只是抽出部分兵力来对抗太平军，并未使出全力。一个倾尽全力没有后续支撑力量；一个游刃有余，甚至还有后招，谁输谁赢，一目了然。撇开数量不谈，来看军事素养:在最开始的时候，二者战斗素养都差不多，再加上清兵畏战因此太平军才能稍微占上上风。不过到了中后期的时候，清政府派出了正儿八经的将领，清军的战斗素养立刻得到了提升，而太平军仍旧是老样子；再加上连续损失将领，后期的太平军几乎进入了群龙无首的状态。
