整个杨文干谋反事件，看似虎头蛇尾，但在这其中，却隐藏了几个值得深思的问题。
第一，李渊当时是支持太子李建成的，根本没有废黜李建成太子之位的意思。李建成也不是傻子，在这种情况下，最好的选择就是等待。只要等到李渊挂掉的那一天，他作为太子，自然能够名正言顺的登基上位，根本用不着玩提前政变这种手段。
第二，事情败露之后，如果李建成真的是早就准备发动政变，那为什么还要去李渊那里认错呢？要知道，这个时候，李建成正在监国，整个国家的权力都在他手上。如果他为这场政变准备已久的话，这时候是最好的机会。与其去李渊那边认错，引起李渊的怀疑，而且还会失去自己的重要下属，李建成为什么不直接反叛，直接发动政变呢？
第三，李渊当时派去找杨文干来对峙的那个人，也很奇怪。因为那个人到了杨文干那边之后，据史书记载，是'据实相告'。也就是说，那个人到了杨文干那边之后，将李渊已经得知太子要造反这些事情，全都说了出来。这不合常理啊！如果是正常人的话，这时候不是应该用各种手段，先解决杨文干手里的兵权，然后用各种手段甚至是蒙骗，将杨文干带去李渊那边才对吗？为什么反倒要据实相告，让杨文干误以为是事情败露，然后不得不直接造反呢？
