但到底是自己的亲儿子，而且还是比较受宠的儿子，朱元璋一忍再忍，希望朱檀能适可而止，早日回归正途。可惜朱檀此时已鬼迷心窍，在王妃汤氏的撺掇下，执意要一条道走到黑，十头牛也拉不回来。
朱元璋终于忍无可忍了，他将朱檀夫妇召回京城，当即就把儿媳赐死了。至于朱檀，他还是顾及父子情分，只把他头发剃掉以示惩戒，希望他还能改过自新。可惜朱元璋一番苦心，最后仍没得到预想效果，朱檀回到封地后依旧沉迷修仙，20岁那年因误食金丹暴病而亡。
朱檀死后，朱元璋仍反愤恨不平，就给他定了个"荒"的谥号来羞辱他。一个父亲给儿子定这种恶谥，在历史上也是罕见。
