孔融的母亲也说道：“年长的人应当承担，是我的罪过。”朝廷最终判处孔褒有罪，孔家人争着承担罪名的事儿却流传甚广，孔融因此声名鹊起。
出了名的孔融开始逐渐膨胀，变得目中无人。和平原名士陶丘洪、陈留名士边让齐名，州郡官员以礼策命，他都不到场。
汉献帝在位时期，孔融历任北军中侯、北海相、青州刺史等官职。
孔融多次轻慢曹操，使得曹操极为不满。
建安十二年（207年），曹操征讨乌桓，孔融讥讽说：“大将军远征乌桓，使得海外萧条，从前肃慎人拒绝进贡弓箭，丁零人盗窃苏武的牛羊，可以一并讨伐啊！”
当时，战乱不断，饥荒频繁，曹操上书建议朝廷禁酒，孔融屡次给曹操写信，要求取消禁酒令，言辞之间，多有傲慢无礼之语。
孔融是名扬海内外的人物，这种人的言论直接影响着舆论导向。
曹操认为孔融的存在，对自己篡权不利，大臣郗虑揣摩曹操的心思，于是搬弄是非，诬陷孔融诽谤朝廷。
曹操蓄积已久的忌恨终于爆发，他唆使丞相军祭酒路粹上书，捏造孔融的罪名。
路粹说孔融“昔在北海，见王室不静，而招合徒众，欲图不轨”，还说孔融散布不法言论，曾说过：“我大圣之后，而见灭于宋，有天下者，何必卯金刀！”还曾和孙权有往来，恶意诽谤朝廷。
建安十三年（208年）八月，孔融被处死，时年五十六岁，同时株连全家，儿子都被诛斩。
孔融的罪状中有一条是“孝行有亏”。孔融和祢衡聊天，说了一句大逆不道的话：“父之于子，当有何亲？论其本意，实为情欲发耳。子之于母，亦复奚为？譬如寄物缶中，出则离矣。”
意思是：父亲对于儿子来说，没有亲情可言，探究源头，不过是情和欲的产物；儿子对于母亲来说，就如同在瓦罐里放了一个东西，取出来，这东西就和瓦罐没啥关系了！
这种言论在崇尚孝道的汉朝，无疑是离经叛道，狂悖至极。
至于这段话究竟是路粹的诬陷，还是孔融的酒后的胡言乱语，因史料有限，早已无法澄清了。
