清军虽然入关，并不意味着就得到了天下，几乎在同时，朱由崧逃到了浦口，魏国公徐弘基等人渡江将其迎回，之后在群臣的拥立下登基称帝，国号依然为"明"，史称南明，年号弘光。
可是此时的南明政权并不稳固，清军南下一路势如破竹，尤其是史可法坐镇的扬州被攻破以后人人自危，后来清军兵临南京城下，南明朝堂一些大臣叛变投降，在里应外合之下，南京城被攻破，弘光帝也成为了俘虏。
在这种情况之下，江南地区的人们看到了大势已去，逐渐丧失了抵抗之心，而为了能够让这些百姓归附，多尔衮采取了怀柔政策，向江南地区的百姓承诺，投降大清之后，一切照旧。
而江阴这座小城也正是在这时候投降的，此地明朝的知县林之骥解印去职，清朝方亨继任江阴知县，其他地方也是如此。
