一直以来，关于她的墓葬所在都是一个谜，有人认为李隆基处死她之后，把她扔到了乱葬岗，没有给她好好安葬。但有的史书上却记载，上官婉儿不仅有一个不错的墓葬，而且陪葬品还很多。当然，这其中那个说法是对的，我们无法知晓。
但是，2013年，专家偶然发现了一个墓葬，西安咸阳，规模比较大。起先，专家也不知道这墓主人是谁，但有个好东西叫做墓志铭，从上面记载的主人的生平来看，这主人就是上官婉儿。专家很是开心，不仅揭开了她的墓葬谜团，而且还有这么多陪葬。
但随着墓葬的开挖，一件奇怪的事情发生了，里面没有尸骨，难道说上官婉儿是衣冠冢？从里面残留的东西来看，绝对不是，还有一些碎骨残渣，那么就是被人偷走了。专家仔细研究过墓室的构造和痕迹。
客观来说，这墓葬不像是被盗墓贼光顾过的，倒有点像是官盗。因此，里面大部分值钱东西都还在，唯独尸首不翼而飞，哪个盗墓贼会干这种事情，只有官方政府。难道是李隆基把她下葬之后，又拿出来抛尸了。
按照道理来说，唐玄宗应该不会干这样的事情，毕竟对于上官婉儿的能力，他还是肯定的。不过，还有一种可能就是，某个盗墓贼癖好比较特殊，不喜欢钱，就喜欢尸首，不过专家认为从现场的痕迹来看，这种可能性小太小。
