马皇后不仅把后宫之事处理的井井有条，前朝的政事她也会过问。有一次朱元璋下朝的时候她问道："今天下民安乎？"朱元璋回答说："此非尔所宜问。"这样的回答在当时来说确实是无可厚非的，毕竟历朝历代都规定后宫不得干政，但是我们的马皇后一本正经的说到："陛下天下父，妾辱天下母，子之安否，何可不问？"朱元璋听了这话之后深以为然，是啊，他们是一起打天下的夫妻，朱元璋能有今天马皇后功不可没，虽然称帝了，但马皇后依旧是他的贤内助。
从此以后朱元璋再也不会过问马皇后干政之事，也正因为如此马皇后多次劝阻了朱元璋滥杀的行为，救下了很多人的性命。后期朱元璋脾气更加暴躁，他的决定除了马皇后没人敢违背。当时他的侄子朱文正因为对赏赐不满生出异心想要背叛朱元璋，他听说了之后火冒三丈当即下令要把他处死，最后还是马皇后劝说这是他的亲侄子，罪不致于，朱元璋才饶了他一命。后来的开国功臣宋濂也是，当时宋濂的孙子牵涉进了一桩谋逆案中，朱元璋下令把已经退休的宋濂召回京城，想要杀了他，宋濂不仅是功臣还曾是太子的老师，听说朱元璋要杀他太子急忙前去求情，但都被驳回了，太子眼看老师就要被杀，羞愤的投湖自尽，但最后被侍卫救了回来。
就在所有人都劝不了朱元璋的时候马皇后出现了，她吩咐把当天的食物全部换成素的，朱元璋问及原由，她回答道："寻常老百姓请个先生都要礼遇一生，宋先生尽心尽力教诲诸子，我理应为他吃素祈福。"朱元璋听了，知道又是为宋濂求情，气头上把筷子一扔而去，但事后还是放过了宋濂，免于一死，发配到茂州。
