而魏忠贤阉党的势起，正好打压住了东林党一方独掌朝政的势力，年轻的朱由检并没有看出这方面的朝政格局，只是看不顺眼魏忠贤而除之后快，最后导致东林党兴起，而使自己后来用大部分的精力与东林党抗衡。
东林党表面上看是为民请命的做派，而实际上他们都是江南那些土绅、富豪的代言人，他们的言行都与自己的利益挂勾，当年有魏忠贤打压而不得逞，随着魏忠贤的死，东林党一派也迅速扩张起来，可以说是社会最大的"蠹虫"。只可惜朱由检并没有认识到这一点。
因此，李自成攻入北京城时，崇祯皇帝朱由检在前殿鸣钟召集百官，却无一人前来，他说："诸臣误朕也，国君死社稷，二百七十七年之天下，一旦弃之，皆为奸臣所误，以至于此。"最后在景山歪脖树上自缢身亡。
