但到了明朝末年，李自成率领着农民军，兵临城下时，崇祯帝才对除去魏忠贤，感到追悔莫及。当时的崇祯帝更是下旨，令人收敛魏忠贤的骸骨进行安葬。崇祯帝为何后悔诛杀了魏忠贤呢？这是因为魏忠贤被铲除以后，明廷被东林党所掌控。东林党是江南士族利益集团的代表。一旦朝廷发布损害他们利益的诏令，便会很难推行。明廷利益的根本就是赋税。明末时期，朝廷需要赋税，但江南士族却不想纳税。
要知道的是，明朝时期的工商业十分发达。明朝末期，天灾泛滥，百姓生活困难，农业税难以征收，各路起义军接连起义，在关外更有虎视眈眈的清兵时常扣关。在这特殊的时期，崇祯帝最正确的选择便是减少百姓缴纳农业税，同时提高士族所缴纳的工商税。
魏忠贤专权期间，为何就没有爆发过大规模的农民起义呢？原因很简单，那时的明廷并不缺钱。魏忠贤专权疯狂敛财的同时，也间接帮助明廷征收了大量的工商税。这样一来边关将士的粮饷既得到了解决，还不会给百姓增加负担。于是中原地区便鲜少有起义闹事者出现，关外将士也才肯用命去抵抗清军。
