得知秣陵被占后，刘繇部将樊能、于糜等人认为孙策主力都集中在城中，便打起了牛渚的主意，准备集中主力发动进攻，夺回牛渚这一战略要地。切断孙策的退路。谁知孙策反应神速，仅留下部分兵力镇守秣陵城，自己亲率主力驰援牛渚。在牛渚一带，孙策与樊能、于糜展开激战，大败对手，并活捉了一万多人。
击败樊能、于糜之后，孙策再度回军围攻笮融的据点。据《三国志•孙破虏讨逆传》注引《江表传》载，在进攻过程中，孙策"为流矢所中，伤股，不能乘马，因自舆还牛渚营。"此后，孙策大军中有几名士卒叛变，并将孙策身负重伤的消息告诉了笮融。笮融大喜，下令全军向牛渚发动进攻，企图在孙策大军撤回牛渚之前将其全歼。
在这危急时刻，孙策临危不乱。他先派出数百士卒前去迎战并故意诈败，大军主力则在不远处的险峻之处埋伏。不明真相的笮融以为孙策大军士气全无，贸然进攻，结果进入了孙策的包围圈，遭遇重创，被杀数千人，只得仓皇逃回秣陵城南据点。孙策大军随即将笮融团团包围。
