然而太子李重俊率军继续攻打皇城，欲将上官婉儿杀之而后快。尽管此次政变失败，但对上官婉儿来说，无疑是当头一棒，太子李重俊事败被杀，上官婉儿也算是凶手之一。
唐隆政变（公元710年7月21日）的另一个主角，唐睿宗李旦（公元662年－公元716年）的三子李隆基，虽然他与上官婉儿毫无交情，但早就已看上官婉儿不顺眼了。何况马上就要分蛋糕了（权力），唐玄宗李隆基（公元685年9月8日－公元762年5月3日）不会继续让上官婉儿继续活着，那只会让对手太平公主如虎添翼。
因此，当刘幽求（公元655年－公元715年，唐朝宰相）拿着太平公主与上官婉儿密谋的证据，为上官婉儿求情的时候，李隆基没答应，马上斩了上官婉儿。当时众将士以为李隆基杀红了眼，其实这是李隆基非常明智的选择。曾经那个纯洁的女孩上官婉儿，如今已化身为国之妖孽了。
▲上官婉儿墓志铭
2013年9月上官婉儿的墓在西安发现，随有一千字的墓志铭出土。史书上关于上官婉儿的死是这么写的："公元710年当时任临淄王的李隆基，与太平公主联手诛杀了韦后、安乐公主（李裹儿，公元684年－公元710年7月21日）等人。上官婉儿则被乱军所杀，享年46岁。"然而随上官婉儿墓出土的墓志铭中，只字未提她的死因。
