原因是朱祐樘的童年非常坎坷不幸。他的生母纪氏是广西纪姓土司的女儿，在年龄很小的时候就被收入宫中。据史料推断说，在成化初年的大藤峡之战，明朝政府军俘获了大量的瑶族的子女。其中面貌姣好的女孩便被送入宫中做了宫女。朱祐樘生母纪氏便位在其中。纪氏聪慧，而且知书达礼，入宫后被指派负责内库做一些管理事务。
一次明帝宪宗帝偶然经过内库，见纪氏美貌聪慧，相谈之后觉得女子说话得体，甚是喜欢，就在此留宿了一晚。后被当时得宠的万贵妃知道，随即命令身边的宫女去为纪氏堕胎。要纪氏打掉肚子里的孩子，但纪氏平时的为人较好，被派来的宫人不忍下手，便撒谎回报万妃说是肚内长毒瘤而不是怀孕，但是万贵妃仍是不放心，就下令将纪氏下贬入冷宫。纪氏是在万贵妃的阴影下，于冷宫中偷偷生下的皇子朱佑樘。
后来万贵妃得知纪氏生子后，就又派门下太监张敏去溺死新皇子。但张敏效忠皇权，深知宪宗后继无人的痛苦与危机，冒着性命危险，帮助纪氏将婴儿秘密藏起来，每日用米粉哺养。被万贵妃排挤废掉的吴皇后也帮助哺养婴儿。万贵妃后又曾数次搜查，都未找到。朱佑樘在宫内东躲西藏，一直吃百家饭长到六岁。
