然而，蹊跷的是，当蓝玉班师回朝时，朱元璋本打算封蓝玉为梁国公，但后来又改为凉国公。一字之差，却耐人寻味。因为蓝玉立功后，嚣张跋扈，不仅在喜峰关炮轰自家城门，而且和被俘虏的元朝嫔妃有染，在归来后，还屡次发表狂言，认为朱元璋至少应该封他为"太师"（当时只封了太子太傅）。朱元璋虽然表面上表彰蓝玉之功，实际上已经对蓝玉有所厌恶。
洪武二十五年，太子朱标去世，朱元璋让蓝玉为朱标保驾护航的计划彻底落空。朱允炆年幼，蓝玉跋扈，朱元璋担心幼主不振，所以决定把自己隐忍多年的蓝玉，送上了断头台。蓝玉最终以"谋逆罪"被杀，蓝玉被剥皮囊草，灭族。蓝玉案牵连近15000多人，包括傅友德、冯胜、王弼等名将，也都因此案逐渐被牵连。明清两代，蓝玉都被列入《逆臣录》，未能翻身。
根据《明史》记载"族诛之"的结论，蓝玉应该没有后代。而且，蓝玉的女儿是蜀王朱椿（朱元璋第十一子）的王妃，朱元璋令其自尽，朱元璋连自己的儿媳妇都不放过，所以，蓝氏一族，恐怕应该没有漏网之鱼。但在江苏宜兴有一位姓吴村民，拿出族谱，宣称自己是蓝玉后人，专家鉴定后表示：非常可信！令人意外的是，这位姓吴的村民，拿出的确实姓周的族谱，这份族谱名叫《宜兴周氏族谱》中，族谱的编修时间是民国三十七年（1948年）。族谱中这样介绍：
