不幸的是，冯云山的早逝和湘军攻破南京后对太平天国的报复性破坏，导致冯云山大量史料的流失。从太平天国领导人的只言片语中，我们可以看出冯云山是一个什么样的人。洪秀全称冯云山为"三兄"，这不是三哥的意思，而是洪秀全认为耶稣是上帝的长子，他排名第二，第三是冯云山。杨秀清这样评价冯云山:"历山河之险阻，尝风雨之艰难，去国离乡，抛妻弃子，历尽艰辛，坚耐到底。"
至于冯云山的死亡地点，比较为大家所认可的是在湖广交界的蓑衣渡。咸丰二年（公元1852年）的4月23日，太平军围攻桂林失败。当他们沿湘江北上湘桂边境的蓑衣渡时，被湘军的江忠源率部拦截。战斗中，冯云山是中炮而死。据说冯云山死后被秘密安葬在蓑衣渡的西沙波。
当清军找到冯云山的墓地时，"刨出贼尸，系用红绫包裹，当经即戮尸，将其首级并获犯周永兴解赴省城。"曾经率部顽强抵抗清军的冯云山，落得个身首异处的结局。此外，太平天国早期的规章制度几乎都是冯云山制定的，冯云山为太平天国的早期发展做出了巨大贡献。可以说冯云山搭建了太平天国的架子，如果他不是过早战死，或许太平天国起义也可能取得成功。
