蓝玉总兵多年，磨下骁将十数人，威望很高。洪武二十六年（1393年）朱元璋的特务组织锦衣卫官员首告蓝玉谋反，说他和景川侯曹震等公侯打算在朱元璋出去籍田时起事，审讯结果，连坐被族诛的一万五干多人。这一案把军中勇武刚强之土差不多杀了个干净。
胡惟庸被杀后十年，洪武二十三年（1363年），太师韩国公李善长也被牵涉到胡惟庸案里，朱元璋假托有星变，得杀大臣应灾，把李善长和妻女弟侄家口七十余人一起杀掉，这年李善长已经七十七岁了。一年后有人替他上疏喊冤说：问得都有道理，朱元璋看了，无话可驳，只好算了。
案以外，开国功臣被杀的，洪武八年（1375年）德庆侯廖永忠以僭用龙凤不法等事赐死；十三年（1380年）永嘉侯朱亮祖父子被鞭死；十七年（1384年）临川侯胡美以犯禁死；二十五年（1392年）江夏侯周德兴以帷薄不修的暖昧罪状被杀；二十七年（1394年）杀定远侯王弼、永平侯谢成、颖国公傅友德；二十八年（1395年）杀宋国公冯胜。不但列将以次被杀，甚至坚守南昌七十五日，力拒陈友谅立了大功的朱元璋的义子亲侄朱文正也以"亲近儒生，胸怀怨望"被鞭死。义子亲甥李文忠南征北伐，立了大功，也因为左右多儒生，礼贤下士，被毒死。徐达为开国功臣第一人。洪武十八年（1385年）生背疽，据说这病最忌吃蒸鹅，病重时朱元璋却特赐蒸鹅，徐达流泪当着使臣的面吃下，不多日就死了。
