而谭继洵不仅仅是对儿子一众人的变法不赞同，还有对作为他上司的湖广总督张之洞有意见，当时张之洞主张中学为体，西学为用。不过当下属的，谭继洵就算再怎么不满意也没有正面的反对，任由张之洞弄他的新政。就是这样，当时张之洞与谭继洵的关系不是很好，甚至有点糟糕。不过尽管有矛盾，但是在一起共事还得说得过去才行。当时谭继洵在官场上只希望，无大功，也没小过。而对于张之洞，他也不敢抗衡，只希望能够自保就行。
不过尽管谭继洵的思想很保守，但是依旧没有影响到谭嗣同，甚至说谭继洵越是不同意或者阻止，那么谭嗣同的变法想法就越激烈。后来持续百日的维新变法终于威胁到了慈禧的统治，当时谭嗣同极其戊戌六君子全都被慈禧判处死刑，不过当时的封疆大吏谭继洵却丝毫没有向慈禧为自己的而字求情，他仿佛早就知道儿子谭嗣同会是这样的下场。然而他的上司张之洞，却非常大胆，为自己的学生杨锐求情。但是这个时候已经改变不了慈禧要杀他们的决心，在最后，谭嗣同和杨锐等人还是全部被杀了。
而谭继洵尽管没有为儿子谭嗣同求情，但是也因为儿子的原因被免去官职软禁起来，后来谭继洵为儿子的死写下了一首诗，可能当时的他已经不在乎儿子谭嗣同的对与错，将这个答案让后世人去评论。
